复制起点：原核生物的DNA通常只有一个复制起点，而真核生物的染色体 DNA 上有多个复制起点。这是因为真核生物的基因组较大，多个复制起点可以同时进行 DNA 复制，加快复制速度。

    复制叉移动速度：原核生物的复制叉移动速度比真核生物快。原核生物如大肠杆菌，复制叉移动速度约为每秒 1000 个碱基对，而真核生物复制叉移动速度每秒约为 50 - 100 个碱基对。

    DNA聚合酶：原核生物和真核生物具有不同的 DNA 聚合酶。原核生物主要是 DNA 聚合酶 Ⅲ 负责 DNA链的延伸，DNA聚合酶 Ⅰ 负责引物的切除和填补。真核生物则有多种 DNA聚合酶，如 DNA聚合酶 α 参与引物合成，DNA聚合酶 δ 和 ε 分别负责前导链和后随链的合成等。

    染色体结构：真核生物的DNA与组蛋白等蛋白质结合形成染色体，在DNA合成前需要先进行染色质的解聚等复杂过程。而原核生物的DNA没有核膜包裹，也不与组蛋白结合形成染色体结构，DNA合成相对简单。