1、体内检测技术

    酵母双杂交（Y2H）：高通量筛选蛋白 - 蛋白互作，适用于构建互作网络，但可能存在核定位限制（如膜蛋白需改造）。
    荧光素酶互补实验（LCI）：通过荧光素酶片段重组检测互作，适用于植物活细胞内检测。

2、体外检测技术

    免疫共沉淀（Co-IP）：验证内源性蛋白互作，需特异性抗体，可结合质谱鉴定互作蛋白。
    Pull-down：利用标签蛋白（如 His、GST）纯化互作蛋白，适用于体外验证，需重组蛋白表达。
    表面等离子共振（SPR）：实时定量检测分子亲和力（KD值），需固定配体，灵敏度高。

3、细胞水平检测技术

    荧光共振能量转移（FRET）：检测活细胞内蛋白距离（<10nm），需荧光标记蛋白。
    生物发光共振能量转移（BRET）：无需激发光，背景低，适用于GPCR等膜蛋白互作。