原核生物基因合成直接拼接编码序列，真核生物基因合成需根据表达系统选择“含内含子”或“去内含子”策略，真核基因的内含子可通过合成实现。

一、原核与真核生物基因合成策略的核心差异

    序列设计：原核基因直接合成完整开放阅读框，无需考虑内含子；真核基因需先明确表达系统，若在原核系统表达则剔除内含子，若在真核系统表达可保留或优化内含子。

    结构优化：原核基因侧重密码子偏好性适配（如大肠杆菌的高频密码子），无内含子相关修饰；真核基因若保留内含子，需确保剪接位点（5'端GU、3'端AG）完整，同时适配真核生物的密码子偏好。

    合成流程：原核基因合成后可直接克隆到原核载体；真核基因含内含子时，需验证载体是否兼容真核剪接机制，避免剪接异常。

二、真核基因内含子的合成可行性

    真核基因的内含子可以通过合成实现，关键在于精准模拟天然内含子的核心特征：

    需准确合成内含子的核心元件，包括剪接位点、分支点序列和polypyrimidine tract（多嘧啶区）。

    合成时需控制内含子长度（天然内含子多为100-1000bp），避免过长导致合成效率下降或剪接受阻。

    可根据需求设计“优化型内含子”，比如保留剪接必需序列，简化非必需区域，提升合成成功率和表达效率。